事业单位管理岗办事员和科员的主要区别如下：

职务级别不同：科员是新录用公务员试用期满合格后晋升的职务，而办事员是直接从各类学校毕业生中录用的公务员。

任职条件不同：科员需要具备大学专科、大学本科、获得双学士学位的大学本科毕业生（含学制为六年以上的大学本科毕业生）、研究生班毕业和未获得硕士学位的研究生等条件，而办事员只要是高中和中专毕业生即可。

工作任务和职能不同：科员需要承担比办事员更为重要的工作任务，需要在机关单位中具有一定的决策和管理职能。

薪资和福利待遇不同：随着职级的提升，科员的薪资水平也会相应提高，而办事员则相对较低。

综上所述，事业单位管理岗办事员和科员在职务级别、任职条件、工作任务和职能、薪资和福利待遇等方面存在不同。