刷金刚菩提的刷子是否会染色，取决于金刚菩提的质量。如果金刚菩提是经过人工染色所致，表面的颜色性质不稳定，那么刷子在刷的过程中可能会被染色，对人体的健康也不利。

在刷金刚菩提时，建议选择猪毛刷，其质地较软，适合精刷，且具有抛光、除尘的保养效果。如担心金刚菩提染色，可在使用前进行颜色测试。