云南孔雀山隧道的涌水问题最终通过多种工法的综合运用来解决。在进尺过程中采用了混凝土封孔、胶黏注浆、松散区域大井管排水、疏干排水、固结注浆、破碎裂缝整治、地基加固等一系列技术措施。

通过科学合理的工法应用，成功克服了该地区地层复杂、地质条件恶劣、地下水位高等难题，保证了孔雀山隧道质量和施工安全。