透明防水胶和 js 防水涂料是两种不同类型的防水材料，它们的区别主要在于以下几个方面：

1.性质不同：透明防水胶是一种液态的防水材料，具有透明、无色、无味等特点；js 防水涂料是一种双组份防水材料，由粉料和液料组成，具有防水、抗渗、抗裂等特点。

2.用途不同：透明防水胶主要用于建筑外墙、窗台、阳台等部位的防水；js 防水涂料主要用于厨房、卫生间、地下室等部位的防水。

3.施工方法不同：透明防水胶可以直接涂刷在基层表面，不需要基层处理；js 防水涂料需要先对基层进行处理，然后再涂刷防水涂料。

4.防水效果不同：透明防水胶的防水效果一般，适用于防水要求不高的部位；js 防水涂料的防水效果较好，适用于防水要求较高的部位。

综上所述，透明防水胶和 js 防水涂料是两种不同类型的防水材料，它们的性质、用途、施工方法和防水效果等方面都有所不同。在选择防水材料时，应该根据防水部位、防水要求等因素进行选择。