是的，皮卡车在海南轮渡中算作货车。皮卡车是一种轻型货车，不属于客车范畴。根据国家对汽车的分级规定，皮卡被视为客货两用汽车，因此，在轮渡运输中，皮卡车会被归类为货车。当皮卡车需要过海时，例如通过琼州海峡，它会被视为轻型普通货车进行收费和处理。因此，在计划使用皮卡车过海时，建议提前了解相关的轮渡规定和费用，以确保顺利过海。