南京栖霞寺的免费开放时间是早上6:00至7:00以及晚上17:00之后。

在这段时间内，附近的居民可以进行晨练并自由出入。此外，栖霞山的门票价格根据季节不同而有所变化，淡季时为25元，而旺季则为40元。