旧巴扎是斯科普里清真寺最集中的地区,这一地区的建筑多为典型的奥斯曼建筑。其中最杰出的清真寺是穆斯塔法·帕夏清真寺,建于1492年,之前曾是基督教徒的土地。清真寺由穆斯塔法帕夏出资修建,他是巴耶济德二世和塞利姆一世治世时是奥斯曼帝国杰出的政治人物。

其他重要的清真寺还有位于旧巴扎外侧的伊萨·贝伊清真寺,这座清真寺是在伊萨贝伊死后为纪念他而建设的。