根据我所了解的情况，南郊车管所除了可以备案符合条件的皮卡车，也可以备案皮卡车后盖。但是备案后盖需要满足一定的规定和要求，例如安全性能、尺寸和质量等方面。如果车主想备案皮卡车后盖，建议提前咨询车管所有关人员，并严格按照规定进行操作，以确保自己的车辆能够顺利备案通过。