上下级单位可以发函。在组织机构中，上级单位负责领导下级单位的工作，下级单位则负责执行上级单位的指示。为了传递工作指示、反馈情况、汇报工作进展等，上下级单位之间需要进行沟通联系。发函是一种正式的书面沟通方式，适用于重要的工作指示、通知、报告等。通过函件可以准确记录沟通内容，方便双方核查和追踪工作进程。因此，上下级单位之间可以通过发函进行有效沟通。