一般情况下，电子版无犯罪证明上是有公章的。无犯罪证明是由公安机关开具的，其格式和内容都是固定的，其中包括了公章和公安机关的签名或盖章。

不过，也有一些地方的公安机关可能会采用电子签章的方式，将公章和公安机关的签名或盖章电子化，并与无犯罪证明的电子版一起发送给申请者。这种情况下，电子版无犯罪证明上可能没有实际的公章，但会有电子签章。

因此，电子版无犯罪证明是否有公章，取决于当地公安机关的具体操作方式。如果您需要无犯罪证明，建议直接向当地公安机关咨询相关事宜。