是的，新农合门诊保险一般会设置每年的报销限额，即参保人在一年内享受医疗费用报销的最高金额。这个限额会根据不同地区、不同保险政策而有所不同。一旦参保人的医疗费用超过了限额，超出部分就需要自行承担。