公司居间费收入是公司提供中介服务的收入，需要交纳增值税。按照相关税法规定，公司作为增值税纳税人应自行缴纳增值税，在税率计算上应按照标准税率计算缴纳。因此，公司居间费收入的增值税应由公司自行负担交纳，不应由对方交纳。公司作为中介服务提供方，应该清楚承担自己应履行的税务义务，并准确计算纳税金额，以维护自身合法合规的经营秩序。