根据制作方法，先将醪糟煮熟再放入元宵是正确的步骤。因为醪糟是由糯米、酒曲、水等原料经一定的工艺发酵制成的，需要将其煮熟去除原料的生味，使其香甜可口。

而元宵则是由糯米粉等材料制成的，直接放入未煮熟的醪糟中可能会影响口感，且元宵需要一定的时间来煮熟。

因此，在制作醪糟元宵时，应先将醪糟煮熟，再将元宵放入糖水中加热煮熟，最后再将煮熟的元宵加入已煮熟的醪糟中，搅拌均匀即可。