深圳地铁12号线有灵芝站出入口的，灵芝站位于前进一路与创业二路交叉口附近，车站沿前进一路方向设置。灵芝站是一个转换站，五号线也是从这里经过，深圳地铁12号线共有33个站点。地铁12号线起自南山区左炮台站，自南向北穿越南山中心区、宝安中心区、福永片区、大空港及会展片区后，终至宝安区海上田园东站，是支撑深圳西部发展轴的轨道交通骨干线。