根据宁波市公交智能卡管理有限公司的规定，户籍地不在宁波市的居民，可以持有效证件，到公交卡服务网点或者指定代理网点进行现场实名认证并办理智能卡。因此，余姚户口在宁波是可以办理宁波市公交卡的。但需注意的是，户籍所在地与实际居住地不一致的，需要提供租赁合同等相关材料证明居住地址。