超市的成本可以通过将所有相关支出加总计算，包括商品进货成本、员工工资、租金、水电费等运营费用。同时要考虑到损耗、盗窃等额外成本因素。细化成本分类，定期进行盈亏分析，以便更准确地了解运营状况。同时，不断优化供应链管理、减少浪费和损失，提高运营效率，降低成本。

最终还要结合销售额、利润率等指标，全面分析超市的盈利情况。