杭州公积金通过银行转账方式对公账户缴纳。首先，缴纳单位需要在杭州市住房公积金管理中心网站上下载并填写缴费申请表，然后向所在银行办理公积金转账手续，并按照申请表提供的银行账户信息进行缴费。

缴纳后，单位可以登录杭州市住房公积金管理中心网站查询缴费情况。需要注意的是，单位在缴费前需要确认缴费人员的公积金账户的正确性，否则可能会影响缴费的到账情况。