个体工商户营业执照异常可能有多种原因，如未按时缴纳税费、超过法定期限未经营、涉嫌违法等。一旦发生异常，相关部门会对其进行调查核实，并根据不同情况做出相应处理。处理的时间长短会根据具体情况而定，可能需要几天到几个月的时间。个体工商户应及时了解异常原因，并配合相关部门的调查处理工作，以尽快恢复正常经营。