根据《行政复议法》规定，行政机关应在30日内作出答复，但情况复杂需要延长的，最长不得超过三个月。因此，行政机关在三个月后给出驳回复议申请的答复是合法的。但复议机关必须在具体案件的事实和法律依据下作出决定，并给出充分的理由说明，确保公正合理。