北京地铁12号线目前设有两个起点站，分别是五棵松站和金安桥站。五棵松站位于海淀区中关村南大街与玉渊潭南路交叉口东南侧，是与地铁4号线换乘的关键节点站，也是进入西城区的主要通道。

金安桥站位于昌平区永安路与长春桥路交叉口东北角，是连接北京市中心和昌平科技园区的重要车站。该线全长37.5公里，共设有32个车站，覆盖了海淀、西城、朝阳、丰台、昌平五个区域，是北京市民出行的重要交通枢纽之一。