两个未成年在一起是否可以起诉对方，取决于具体的情况和法律条款。

如果双方没有合法登记结婚，女方有权以孩子的名义起诉对方，请求判令对方及时支付抚养费用。如果女方属于未成年人，对方可能涉嫌刑事犯罪。如果与不满14周岁的女孩发生关系，无论女方是否自愿，男方都构成强奸罪。

然而，如果双方都是未成年人，一般不以犯罪论处，但是还是需要根据实际情况来决定。建议咨询专业律师以获取更详细的信息。