新生儿医保报销流程是：

1、申报人准备好新生儿的住院发票、费用明细单、住院病历等相关材料；

2、参保后新生儿住院的，凭无卡证明办理住院手续；

3、在出院结算时，提交上述材料，使用医保结算系统结算，只支付个人自负部分。