强制险只覆盖车辆在交通事故中对第三方造成的损失，不包括水淹车的赔偿。对于水淹车，需要购买额外的商业险，如车损险或全险。保险公司在理赔时会根据保险合同的条款和条件进行赔偿。

通常情况下，保险公司会派出定损员对车辆进行评估，然后根据车辆的实际价值和损失程度进行赔偿。赔偿金额可能包括车辆修理费用、残值、以及相关的拖车和租车费用等。