门诊费用是可以使用新农合报销的，但是是有一定的报销比例的。村卫生室及村中心卫生室就诊报销60%;镇卫生院就诊报销40%;二级医院就诊报销30%;三级医院就诊报销20%。因此国家还是有规定了一定的报销年限额的，镇级合作医疗门诊报销年限额五千元。