自然人扣缴端设置密码流程：该公司法人或是财务负责人在应用软件下载个人所得税APP，注册之后点击登录。

登录之后点击右下角个人中心，点击个人中心，选择企业报税权限，按步骤提示重置申报密码。

一般纳税人第一次在大厅核定税种时，工作人员会给个随机初始申报密码，如果未取得密码，按以上方式获取。