1.C57BL/6
常被称作“C57 black 6”、“C57”或者“black 6”（标准简称是B6），1921年由C.C.little 培育出来，C57BL/6J是它的一个亚系，也是继人类之后第二个开始基因组测序工程的哺乳类动物。由于其品系稳定，常被认作「标准」的近交系，为许多突变基因提供遗传背景；易于繁殖，所以在建立基因编辑模型小鼠时，往往会选择C57BL/6这一品系的小鼠。

2.BALB/c
BALB/c是另一个常用的小鼠品系，标准简称是“C”这个品系的小鼠具有白化、免疫缺陷的特征。这一品系的小鼠对于致癌物极其敏感，所以在肿瘤研究中应用的非常多。

其它小鼠品系全称及缩写：
CH3
C3
AKR
AK
CBA
CBA
DBA/1
D1
DBA/2
D2
SJL
J
RIIIS/J
R3
昆明小鼠
KM