先天性心脏病的治疗费用3一5万元左右，按国家规定都会报销，但报销比例因为当地财政补贴以及民政局的政策不同而有所差异。

一般报销比例在总费用80%左右，有的地方会全部报销，有的地方规定在指定医院手术治疗全部报销，而不在指定医院手术的则不予报销或部分报销。

具体建议去当地医院心脏外科和民政局去详细了解。