农村重大疾病申请补助的方法包括以下几个步骤：

首先，患者需要到当地农村医保办公室咨询相关政策和申请流程；

其次，患者需要准备相关材料，如疾病诊断证明、医疗费用清单等；

然后，患者填写申请表格，并提交给农村医保办公室；

最后，等待审核结果，一般会在一定时间内给予答复。申请补助时要确保材料齐全、准确，遵守相关规定，以提高申请成功的几率。