代课教师不算工龄的原因是因为代课教师的工作性质和正式教师不同。代课教师通常是在原教师或干部因事假或病假等原因未能到岗时，由教育机构暂时聘请的替代教师。

代课教师的聘用时间通常只限于原教师返回前的期间，所以代课教师的工作时间并未被认定为连续且完整的时间段，不符合工龄的计算标准。