农村自建房两层改一层需要遵循相关法律法规和规定。如果要改建，需要向相关部门申请，获得批准后才可以进行改建。改建过程中要注意房屋结构和安全，定期进行检查和维护。此外，还要考虑改建后的房屋是否符合居住需要。如果条件允许，可以考虑在改建后增加相应的配套设施，提高生活舒适度。