不会。持卡人在自己名下的不同开户银行的银行卡之间办理转账的，属于持卡人自主支配自有资金，银行卡之间的转账符合人民银行支付结算管理办法规定，即存款人取款自由。

银行后台系统不会对此款项的转账进行调查（银行调查主要是针对非法交易和可疑交易进行调查）。