如果车辆因故障违停，应当按照《中华人民共和国道路交通安全法》的规定进行处理。根据该法，违章停车将被处以罚款，但对于车辆故障等特殊情况，可以向交警部门申请免除罚款。

具体的处理方法如下：

立即将车辆移至不妨碍交通的地方，如应急车道或空旷的停车场。同时，开启危险报警闪光灯，并在车后放置警示标志，以提醒其他车辆注意。

如果车辆无法移动，应当在车辆后方设置警示标志，并迅速联系交警部门说明情况，等待处理。

如果车辆故障导致了交通拥堵，车主应当尽快寻求交警部门的帮助，配合疏导交通。

在处理车辆故障违停的情况时，车主应当保持冷静，遵循交通安全法律法规，并积极配合交警部门的处理。同时，为了预防车辆故障违停的发生，车主应该定期对车辆进行检查和维护，确保车辆的安全性和可靠性。