大陆的船只进入澳门水域是有限制的。为了保障澳门水道的通航安全，澳门海事局与广东海事局经过协商，决定从2021年12月1日开始实施一项临时管控措施，禁止船长100米以上的船舶航经澳门水道。

这一措施为期6个月，期间海事局会进行调研论证，以便根据实际需要和临时措施的执行情况作出调整。因此，大陆的船只进入澳门水域需要遵守相关的管控措施和规定。