本科论文交上去后，大学会进行查重，检查是否存在抄袭或剽窃问题。同时，一些学校还会将论文提交到反抄袭网站进行检测。如果存在抄袭或剽窃问题，学校会进行相应的处理，包括但不限于扣分、不给予毕业证书等。因此，学生在写论文时应该认真对待，杜绝抄袭和剽窃行为。