护照、通行证和签注在功能和用途上存在显著的差异。

护照是一个国家的公民出入本国国境和到国外旅行或居留时，由本国颁发的一种证明该公民国籍和身份的证件。它关系到某人在国外的法定利益，并包含持有者的照片、签名、出生日期、国籍等个人信息。护照是公民旅行通过各国国际口岸的一种通行证明，相当于在国外使用的身份证。

通行证则是指准许在某一特定区域通行的证件，例如港澳通行证等。它是对公民出国、入境等行为进行管理的法律规定下的产物，公民需要按照规定的程序和条件办理出入境手续。

签注则是指在证件表册上批注意见或有关事项，常常用于港澳通行证等证件上，标明持证人在港澳地区的滞留时间。

总结来说，护照主要用于证明公民的身份和国籍，通行证用于特定区域的通行，而签注则是对证件上的特定事项进行批注。这三者各自有其独特的功能和使用场景，但都是出国旅行或居留时可能需要的重要文件。