了解原因：首先需要了解该员工未享受专项扣除的具体原因。可能是因为员工没有提交相关的扣除信息，或者是因为公司的人事或财务部门在处理个人所得税时没有正确应用相关政策。
及时沟通：一旦了解了原因，应尽快与员工进行沟通，确保他们了解专项扣除的重要性和提交相关信息的截止日期。如果员工没有提交信息，可以提醒他们尽快提交。
补交申请：如果员工错过了之前的扣除申请，可以向税务机关申请补交相关扣除信息。这可能需要员工提供一些证明文件，如医疗费用发票、子女教育费用凭证等。
调整薪资：如果员工已经离职，无法再享受专项扣除，可以考虑在最后一次发放薪资时进行适当调整，以确保员工的实际收入不受影响。
咨询专业人士：在处理这类问题时，如果公司的人事或财务部门对税收政策不太了解，可以咨询专业的税务顾问或律师，以确保公司的操作符合相关法规和政策。
总之，对于离职人员未享受专项扣除的问题，公司应该尽快了解原因并采取相应措施，确保员工的权益不受损害。同时，公司也应该加强对员工的税收政策宣传和培训，提高员工的税收意识和合规意识。