花椒树的修剪可以根据苗龄合理进行，要是小苗和壮年期的花椒树，可以考虑秋天休眠期修剪 ，这样可以避免伤口流出树液过多，影响花椒树的结果。要是生长差和老花椒树可以在春季简单进行修剪。

花椒树的修剪时间大致在二月份进行，这时的修剪可以剪掉枯枝、病枝。并且由于老树弱树的老枝结果能力差，就要剪掉以及过长的枝条，目的是为了促发更多新枝新芽，让新枝开花结果。修剪同时可以对一些枝条进行牵拉，利于植株的通风透气透光。