异养菌既可以是好氧的，也可以是厌氧的。好氧异养菌在有氧条件下生长，利用氧气作为最终电子受体进行呼吸作用，产生能量。

厌氧异养菌在无氧条件下生长，利用其他无机或有机物作为最终电子受体进行发酵作用，产生能量。

异养菌的呼吸作用和发酵作用都属于异化作用，将有机物分解为简单的无机物，释放能量。