农村厕所改造后若存在污水，可以采取以下几种处理方式。

首先，可以采用分离式生态化厕所，通过分离尿液和粪便，让尿液经过处理后可以作为肥料，粪便则进行沼气发酵和堆肥处理。

其次，可以使用沼气池来处理粪便和厕所废水产生的污水，污水经过沉淀和过滤后排放或者再回收利用。此外，也可以采用生物滤池，通过物理、化学和生物作用的综合处理，达到净化的目的。最后，必须保证良好的运行维护，以确保设施的正常使用和处理效果。