南京凌晨可以入住酒店，但要看具体酒店的入住政策。一些酒店可能在凌晨00:00 - 06:00期间暂停入住，而另一些酒店则可以24小时提供入住服务。建议提前联系酒店或在预订前仔细查看酒店政策，以便做好相应的安排。此外，凌晨时段入住可能需要支付额外费用。如果您计划在南京凌晨入住酒店，请提前了解相关信息，以便安排行程。