如果改造质量不高或设计不合理，自建房楼梯改造可能会破坏主体结构。改造时应确保楼梯与建筑物结构相称，符合安全规范，否则可能引起安全隐患，如拆除承重墙、改变原设计方案等操作，都可能损坏楼体结构。因此，在进行自建房楼梯改造时，一定要采用合适的材料、按照相关标准设计，务必进行专业施工和检测，以保障改造后的楼梯不仅美观实用，还能够经久耐用，不给居民造成任何威胁。