长春市公积金商转公主要有两种方式，每种方式都有其特点和适用情况，选择哪种方式主要取决于借款申请人的具体情况和需求。

以所购住房作抵押先还后贷：这种方式要求借款申请人自筹资金将原商业贷款结清并解除贷款抵押，然后用原商业贷款抵押的房屋作为商转公贷款的抵押担保。这种方式的优点在于，一旦原商业贷款被结清并解除抵押，借款申请人就可以立即开始享受公积金贷款的较低利率。然而，这也要求借款申请人具备足够的自筹资金来结清原商业贷款，因此可能存在一定的资金压力。

以所购住房作顺位抵押：这种方式下，借款申请人无需结清原商业贷款，且抵押权人仍为原商业银行。原商业银行同意增加办理商转公贷款业务的公积金贷款受委托银行为该房屋第二顺位抵押权人，办理顺位抵押登记，并同意协助办理用公积金贷款结清原商业贷款。这种方式的优点在于，借款申请人无需承担结清原商业贷款的资金压力，同时可以享受公积金贷款的优惠利率。但需要注意的是，这种方式可能涉及多个金融机构之间的协调，因此办理流程可能相对复杂。

在选择具体方式时，借款申请人可以考虑以下因素：

资金状况：如果借款申请人有足够的自筹资金来结清原商业贷款，那么第一种方式可能更为合适。否则，第二种方式可能更为实际。

办理流程的复杂性：如果借款申请人希望简化办理流程，减少与多个金融机构的协调，那么第二种方式可能更为适合。

利率优惠的时效性：考虑到公积金贷款的利率优惠，借款申请人可能希望尽快开始享受这一优惠。如果自筹资金充足且能够及时结清原商业贷款，那么第一种方式可能更有利。

综上所述，借款申请人应根据自身实际情况和需求，仔细权衡各种因素，选择最适合自己的商转公方式。同时，建议咨询专业的公积金贷款顾问或相关金融机构，以获取更详细和准确的建议。