上海医保挂号收取6元可能是以下原因：

1. 医保账户余额不足以支付挂号费用。即使使用医保卡挂号，如果医保账户余额不足以支付挂号费用，就需要自费支付额外的6元。

2. 使用了自费项目。在挂号时，如果选择了自费项目，例如高档病房、特殊医疗服务等，就需要自费支付额外的费用。

3. 医保政策差异。不同地区、不同医院可能有不同的医保政策，上海的医保政策可能与您所在的地区有所不同，导致挂号费用有所不同。

需要注意的是，如果您对医保挂号收费有疑问，可以向医院或当地医保部门咨询相关政策规定，以了解具体情况。