征信记录中的民事纠纷信息通常会在五年后自动消除。根据《征信业管理条例》的规定，征信机构不得披露超过五年的不良信用记录。这意味着，一旦民事纠纷信息进入征信系统，它将在五年后自动从征信记录中删除。然而，如果纠纷未解决或仍在进行中，相关信息可能会持续存在。因此，及时解决民事纠纷并履行相关义务是维护良好信用记录的关键。