取出来了 。

在电影《钢铁侠3》中就有描述，托尼斯塔克先是利用手术取出了碎片，并用纳米技术修复身体组织。然后他们遭遇了绝境战士，其中就有一个中国医生询问贾维斯，托尼的身体情况。