特病住院和普通住院在重庆地区的主要区别如下：
1.待遇政策不同：特病住院是指患者因特定疾病住院治疗，可以享受特定的医保政策，如报销比例较高、报销限额较高等。而普通住院则按照常规的医保政策进行报销。
2.疾病范围不同：特病住院主要针对一些特殊疾病，如癌症、器官移植、尿毒症等，这些疾病通常需要长期治疗和较高费用的医疗支出。普通住院则适用于各类疾病，包括常见病和慢性病等。
3.医疗资源分配不同：特病住院往往会在医疗资源上得到优先保障，如床位、专家门诊等。普通住院则需要根据医院的具体情况和患者的需求进行分配。
4.治疗方案不同：特病住院的治疗方案通常更加专业和个性化，针对患者的病情和需求，采用先进的技术和药物。普通住院的治疗方案则根据患者的病情和医院的技术水平进行制定。
需要注意的是，特病住院和普通住院并非绝对的区分，它们之间存在一定的交集。具体选择哪种住院方式需根据患者的病情、医保政策和医院条件等因素综合考虑。希望我的回答对您有所帮助。如果您有更多问题，请随时提问。