船员绿码登记流程如下：首先，船员需要在手机上下载“健康码”APP，并完成个人信息填写。

接着，船员需要进行核酸检测，并将检测结果上传至APP上。如果检测结果为阴性，则船员会获得绿码，证明其健康状况良好。

最后，在登机前或入境前，船员需要向有关部门出示自己的绿码，并接受体温检测等健康监测措施。船员绿码的登记流程简单清晰，需要船员在入境前进行相关的准备工作，避免出现不必要的麻烦。