上海海事大学现有临港校区、港湾校区、民生路高恒大厦等3个校区。

其中，临港校区是目前学校办学主体所在地，于2008年10月基本建成，校园占地面积133万余平方米，总建筑面积60万平方米；港湾校区是学校继续教育、中等职业教育主要办学地。民生路高恒大厦位于浦东大道1608号，总建筑面积33573.87㎡。