新办企业残保金不足一年的情况下，可以在申报中注明该情况，并按照实际缴纳的时间计算应缴纳的残保金，进行申报。同时，可以向当地的残联或人社部门咨询相关政策，了解是否有特殊规定或优惠政策可供参考。

建议企业在尽快补齐残保金的同时，积极配合相关部门的调查工作，保证申报的真实性和合法性。